原子核占据的尺度远小于整个原子的尺度（磁量子数与轨道角动量的空间分量有关）

磁量子数与轨道角动量的空间分量有关。自旋是电子具有的内禀量子性质之一。电子自旋不能直接等同于小球自转图景。泡利不相容原理限制相同费米子的占态。一个原子轨道最多容纳两个自旋相反的电子。电子排布影响元素的化学性质与光谱特征。价电子通常直接参与化学键的形成。屏蔽效应减弱部分电子感受到的核吸引。

中性原子的核外电子数等于质子数。离子的净电荷来自电子数与质子数不等。同位素具有相同质子数而中子数不同。同一种元素可以包含多种天然同位素。质量数等于原子核中质子数与中子数之和。相对原子质量通常是同位素质量的加权平均。原子半径没有像宏观球体那样明确的边界。电离能表示移走束缚电子所需的能量。

有效核电荷反映电子实际感受的核吸引程度。多电子原子中的能级受电子相互作用影响。精细结构与相对论修正及自旋轨道耦合有关。超精细结构涉及原子核与电子磁性质耦合。塞曼效应表现为磁场中谱线发生分裂。斯塔克效应是外电场引起的能级或谱线变化。原子钟利用稳定的原子跃迁建立时间基准。原子冷却可以借助光与原子的动量交换。